衛生防疫應急指揮產品遵循《突發公共衛生事件應急指揮與決策》，主要包括基礎數據管、決策支持、分析、綜合查詢、安全防護等模塊。

1、基礎數據管理

用于對基礎地理與自然環境背景數據庫、全國公共衛生危險因素數據庫、全國傳染病疫情與人口死亡數據庫、全國應急資源數據庫、自然災害數據庫中的數據內容進行采集、維護和管理等功能。

（1）數據采集與管理。采集圖像信息、圖形信息、統計信息、遙測信息、調查與監測信息、文字信息等，不同類型的信息需要應用不同的信息獲取技術。

（2）空間數據維護。以地理信息空間數據庫和數據倉庫的方式統一管理地理空間數據和相應的屬性數據。

（3）疫情上報與更新。衛生部各下屬單位獲得災情信息后，將所掌握的信息通過該系統進行上報，當災情發生變化或被消除后，將實時更新災情信息。

（4）預案、方案的制作與維護。存儲由各專業系統的模擬、評價和虛擬現實所產生的各種預案，供專業決策和綜合會商決策調用。

（5）各類活動管理功能。囊括應急項目管理、重大活動管理、應急會議管理、學習考察管理、宣傳教育管理、信息發布管理和通報交流管理等功能。

2、決策支持、分析

通過現有數據結合GIS空間分析功能，預測疫情的發生、分析疫情發展、實現處置決策。

（1）疫情預警監控?；谏蠄蟮囊咔閿祿魅緜€體的活動進行實時監控，對可能影響因素的數據進行整合、分析和判斷，建立診斷和預測模型，對易造成疾病爆發、流行或危害的分布狀態及危險因素予以監控。

（2）會商決策管理?；跁谭绞竭M行方案研討、判定事件性質、擬訂處理措施，展現疫情信息、事件信息、綜合信息等各類會商信息，同時支持聲音、文字、數字、圖形、圖象的顯示，把指揮中心應急形勢迅速展現到會商現場。

（3）處置決策功能?；诜治鍪鹿实南嚓P數據，建立災種的分析模型，并比選相應的應急處置預案，提供疫情危害范圍、災害損失估算。

（4）指令下達功能。應急處置決策完成后，衛生部通過系統向各下屬單位發布指令。系統將預制各類指令格式，為系統使用人員提供便利。

（5）考評、評估功能。包括事件評估、應急能力評估、績效考核考評功能。

（6）數據輸出功能。將系統分析結果以數據、表格、圖像、圖形等實現數據輸出，包括屏幕顯示和打印輸出。

3、綜合查詢

將各類衛生信息進行發布，供具備相關權限的人員對其進行瀏覽、查詢，包括屬性查詢、空間查詢、事件查詢檢索、信息標繪等。

4、安全防護

包括用戶管理、系統配置、數據備份恢復、系統日志、數據字典管理等功能。